Normalmente, os passos para a exclusão de um produto da loja seriam os seguintes:

1. No Admin VTEX, acesse Catálogo, ou digite Catálogo na barra de busca no topo da página.
2. Clique em Todos os produtos.
3. Faça uma busca pelo produto desejado.
4. Na linha do produto, clique na seta ao lado de Alterar.
5. Clique em Excluir.

No entanto, uma vez que o produto em questão tenha alguma referência a outra área do sistema (o que é bastante comum), não é mais possível excluí-lo da base.

Neste caso, a seguinte mensagem de erro aparece ao tentar excluí-lo:

A solução é inativar o produto. Veja como no artigo Inativar SKUs e produtos da loja.