A ordenação das categorias no admin não é refletida no front da loja ao utilizar controles de navegação nativos da VTEX.

1. No menu lateral, clique em Catálogo.
2. Clique em Categorias.
3. Clique em um departamento que possua categorias ou uma categoria com sub-categorias.
4. Acesse Ações > Alterar.
5. Na seção de categorias filhas, realize a ordenação que deseja.
6. Clique em Salvar.

Atualmente, a única solução é realizar a ordenação das categorias por meio de uma customização com Javascript no front-end.