A faixa de R$ 0 a R$ X no filtro de preço considera produtos indisponíveis.

1. Entre no módulo "E-commerce"
2. Aba "Cadastro de produto" > "Categoria"
3. Selecione uma categoria
4. Clique em "Ações" > "Faixa de preço"
5. Escreva as faixas desejas começando pela "R$ 0 a R$ X"
6. No front da loja ao filtrar pela faixa "R$ 0 a R$ X" aparecerão os produtos indisponíveis mesmo que tenham preços maiores cadastrados.

Ao inserir a faixa de preço mais baixa não começe por R$ 0 (zero) coloque R$ 0,01 ou R$ 1. Assim os produtos indisponíveis não serão contabilizados nesta faixa de preço.