Esse cenário acontece quando mais de um item do mesmo SKU é separado em mais de uma linha no carrinho. Isso ocorre por uma ação denominada rateio - é a divisão de um valor entre os itens.

Porém, existem cenários em que o valor do desconto é indivisível pelo número de itens, principalmente em casos em que o SKU possui uma unidade multiplicadora e, por isso, é preciso dar descontos diferentes para itens de um mesmo SKU para que o valor do desconto fique correto. O que acaba por deixar os preços diferentes e separando cada unidade em uma linha. Visualize melhor essa explicação com exemplo abaixo:

1. Unidade multiplicadora.
2. Preço do produto após o desconto.
3. Preço do produto com a diferença, devido ao rateio.
4. Desconto aplicado.